Il existe peu d'interactions ou de contre indications entre les traitements de la SEP et les traitements d'autres maladies. Certaines précautions ou contre indications spécifiques peuvent cependant exister par exemple :

- Intramusculaires d'AVONEX et antivitamines K (Préviscan) en raison du risque de survenue d'hématomes pouvant comprimer le nerf sciatique
- SOLUMEDROL et diabète
- TYSABRI et traitement immunosuppresseur ou immunomodulateur.

Un infarctus du myocarde ne contre indique par contre pas un traitement par TYSABRI.

Il n'y a a priori aucune contre indication au traitement par Avonex dans l'asthme. D'autres traitements peuvent aggraver l'asthme mais pas les interféron bêta.

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